Czy zwiększyłes opóźnienie sygnału kroku do kierunku o którym pisałem?
Przeczytaj temat który ci podlinkowalem, u mnie te wartości wpisywane w tych oknach nie zapisywały się do użycia.

Może to być zbyt małe opóźnienie sygnału kroku względem kierunku.
Ja z macha mało co pamiętam, bo używałem go bardzo krótko i było to już parę lat temu.
Właśnie przypomniałem sobie, że miałem sytuację chyba nieco podobną. Odszukałem temat, poczytaj sobie:
mach-3-problem-z-przesuwaniem-wspolrzed ... 24-10.html
Jedyne co nie pasuje, to twoja relacja, że przy frezowaniu 2D wszystko działa poprawnie.
Więc albo frezujesz tak proste kształty 2D, że nie zauważasz przesunięcia, albo coś kręcisz albo to zupełnie inny problem.

Bez sensu. Maszyna działa kilka lat, frezuje w drewnie i ma gubić na szybkich przejazdach albo w grubszym "mięsie"? Przecież to się kupy nie trzyma. Przy frezowaniu 2D/2.5D także występują szybkie przejazdy i także występuje frezowanie grubego materiału.
Do autora. Pokaż program do tego zdjęcia z pierwszego postu.