Miałem podobny problem. Przy sterowaniu z klawiatury można było uzyskać max 1300mm/min i dało się słyszeć takie stukanie. Jakby zgubiony krok, ale silnik przy tych prędkościach nie tracił jeszcze synchronizacji. Po wymianie komputera na STARSZY problem ustąpił. Bez problemu osiągam 4000mm. Z tym że u Ciebie jest jakby odwrotnie. Nie wiem od czego to zależało, pewnie od sterownika portu lpt. W tym nowym, był wykonany na "odpieprz się" wychodząc z założenia że i tak nikt nie będzie z niego korzystać.