Z instrukcji:
"(...)
17 - charge pump/enable
(...)

Rodzaj sygnału zezwalającego na załączanie przekaźników (z pinu nr 17) jest ustawiany przy pomocy zworki.
Możliwe są ustawienia: zawsze zezwolone, pompa ładunkowa, enable=0 albo enable=1
Układ pompy ładunkowej (charge pump) przy wspołpracy z programem mającym taką funkcję (np. Mach) eliminuje przypadkowe załączanie przekaźników przy starcie/restarcie komputera, jeżeli zasilanie sterownika jest w tym czasie włączone.
(...)
Dodatkowe zworki umożliwiają konfigurację:
- użycie sygnału zezwolenia dla przekaźników do załączania prądu silników
- wyłączanie prądu silników po rozwarciu obwodu ESTOP.
(...)"

Z tym pokombinuj.

Jeśli faktycznie ustawiłeś właściwy pin dla przekaźnika, to musi działać. Sprawdź czy przypadkiem jak załączasz program to przekaźnik się już nie włącza (lub jest ciągle załączony niezależnie od stanu przycisku wrzeciona)? (bo potem już nie da rady go załączyć skoro już jest włączony) W takim wypadku powinno pomóc odwrócenie stanu (każdy pin ma taką opcję do zaznaczenia - kwadracik po prawej). Miałem dwie maszynki na tych sterownikach i nie zauważyłem żadnych problemów z konfiguracją przekaźnika, ale nie pamiętam teraz czy zaznaczałem odwrócenie stanu. Z PWM-em nie podpowiem, bo nie korzystałem jeszcze z tej funkcji.