Przy tego typu błędach pasowałoby przeanalizować cały odcinek pracy narzędzia.
Najlepiej takie próby wykonać poza materiałem. Sprawdzasz wtedy, czy korekcja została wczytana, na którym konkretnie bloku występuje problem. Czasem odcinek przyjęcia jest za krótki,
niekiedy wczytanie korekcji łącznie z łukiem może mieć znaczenie.
Iso generujesz na łuki G2/G3 czy na punkty? Może tolerancja programu robi robotę.
Swego czasu na HH generowałem po prostu za krótkie odcinki, które musiałem ręcznie usuwać.

W twoim przypadku rzeczywiście zacząłbym od zmniejszenia R w maszynie. Można jeszcze prze-generować kod na większy promień, dla którego na pewno masz jakąś tolerancję.