Strunę uzupełnić lupą pomiarową z podziałką (zwykle 0,1mm, są dokładniejsze),
tylko trzeba wykombinować odpowiedni uchwyt,
aby "fokusa" nie gubić i zapewnić powtarzalność pomiaru.

Płaszczyzna bazy pod prowadnicę (poprzeczna): poziomica maszynowa 0,02mm/m

Różnica poziomów między belkami i rozstaw prowadnic:
dodatkowe ramię pomiarowe z zamontowanymi wózkami
(profil zamknięty o odpowiednim przekroju).

Ze strony (pomiarowej) wózek "pływający" w poziomie
i regulowany w pionie - obok czujnik zegarowy (pomiar w poziomie).
Z drugiej strony wózek zamontowany "elastycznie" - tak aby odchylenia
drugiego końca ramienia nie zniszczyły wózka(ów).

Na ramieniu kładziemy poziomicę maszynową 0,02mm/m.
Przy rozstawie prowadnic 4,5m ~ 0,1mm różnica poziomów.
Sam rozstaw prowadnic - zgodnie z dokładnością czujnika zegarowego.

Inne rozwiązanie:
zapłacić właścicielowi interferometru laserowego za pomoc...

(jak widziałem tą wasserwagę budowlaną na zdjęciach z montażu...)

Na zdjęciach wyraźnie widać, że jest przykręcona do podłoża,
pytanie tylko, czy ma ono dostateczną sztywność.
Dodałbym zastrzały przy podporach prowadnic głównych.

Schemat konstrukcyjny obrabiarki jest typowy
przy takim (lub większym) polu roboczym
i podobnym przeznaczeniu.

np.

http://www.cncmotion.com/titangallery.htm

czy

http://www.ebay.com/itm/5-axis-CNC-Gant ... 1030991244
(ot ciekawostka, używana, cena tylko 499000$)

Też bym popracował nad profilami prędkości.
Tutaj jest długa Z-tka, działająca jak wahadło, ze swoim okresem drgań.
Można pomyśleć np. nad tłumikiem lepkościowym.

Jeszcze trochę wysiłku po stronie wykonawcy
a cierpliwości po stronie zamawiającej
i maszynka powinna śmigać.