Poradziłem sobie już z tym problemem. Może komuś się przyda ta informacja. Wyznaczyłem dla obrabianej powierzchni 3 pola granicy które pionowo łączyły się przechodząc przez środek otworów. W ten sposób musiałem wygenerować trzy operacje dla jednej powierzchni i udało mi się pozbyć nieobrobionych pasków. Rysunek poniżej:
