To o czym piszesz, pomijając problemy mechaniczne to bardzo częsty objaw zbyt dużego czasu narastania lub opadania zbocza sygnału STEP/DIR (szczególnie DIR) transoptorów na wejściach modułu sterownika silnika (lub w module optoizolacji portu LPT) lub ich zakłóceń. Co prawda objaw gubienia kroków w ty przypadku powinien się pogłębiać ze wzrostem prędkości posuwu ale bez względu na jej wartość prawie zawsze jest widoczny. Krótko mówiąc najlepiej jest stosować szybkie transoptorki z wyjściem TTL np. 6N137.