Tylko 5V? To nie ma się co dziwić, że nie działa.
5 V masz podawane na płytę z komputera przez złącze USB, podobnie jak sygnały z portu lpt.

Ta płyta wymaga dodatkowego zasilania 12-24V i jest do tego przeznaczone złącze ARK. Podłącz to zasilenie pod płytę i wtedy testuj.

Jak ma coś działać jak brak jest zasilania!!

Wywal tego macha i zainstaluj Debiana z Linuxcnc.
Zobaczysz, że robota będzie o wiele prostsza

A 24V na płytę masz podłączone?
Jaki komputer masz do tego ? z fizycznym portem lpt czy jakieś przejściówki?
Jaką masz wersje windowsa 32 czy 64 bit?
Jeśli 64bit to może być problem bo nie obsłuży portu lpt.
Miałem taki przypadek, walczyłem chyba z tydzień z tym co Ty , a okazało się, że wina leżała po stronie windowsa. Mach3 działał prawidłowo pod 32bit wersją.
Jak dobrze poszukasz to znajdziesz na necie to o czym pisze.

p.s. wywal tego macha i postaw linuxcnc, zero kłopotów i radość z pracy