Rozumiem że tap to rozszerzenie pliku gkodu? Dziwne bo wielkość pliku nie powinna wpływać na jakość ruchu silników, możliwe że komp nie nada się do sterowania.
Co możesz zrobić:
w biosie wyłącz hyper threading, frequency scaling i tym podobne.
port LPT w trybie EPP lib ECP + EPP

po tym sprawdź jeszcze raz latency-test, wprowadź BASE_THREAD jako 10000 + max base thread latency i przetestuj maszynę jeszcze raz.
Jak ktoś może to ucieka od sterowania maszyną bezpośrednio prze LPT właśnie z tych powodów, trzeba mieć szczęście lub wiedzieć jak zmusić ustrojstwo do działania z jakimś konkretnym komputerem.

Uruchom program 'latency-test' na parę godzin i wstaw tu wyniki po tym czasie

Jak sterownik przyjmuje do 300k impulsów to minimalna długość kroku to:
(1/300000)*1000000000 = 3333 (czas kroku w ns).
W konfiguracji używającej portu LPT możesz spokojnie podwoić ten wynik i tą wartość (6666) wpisujesz do steplen i stepspace.
A w dirsetup i dirhold wpisz bezpiecznie po 10000 i już.

Wartości steplen, stepspace, dirhold i dirsetup są w nanosekundach i powinieneś je ustawić wg instrukcji Twojego sterownika krokowego. Jeśli nie masz takich informacji wpisz w tych 4 pozycjach wartość 5000, wygenruj konfigurację i przetestuj. Reszta konfiguracji wygląda rozsądnie.

Wrzuć gdzieś plik ini i hal maszyny.