Jeśli ten dysk ma jakiś ogólnie znany system plików (np. FAT, FAT16, FAT32, NTFS, HPFS) , to można spróbować tego co poniżej, w innym przypadku może być duży kłopot.

Na dzień dobry sprawdź, czy czasami nie włączyłeś przypadkiem (albo kto inny) kompresji dysku.
Jeśli tak, to "odptaszyć" kompresję.
Jeśli nie, to:

Proponuję wymontować dysk, podpiąć do innego kompa i zrobić obraz CAŁEGO dysku jakimś softem do tego (np. Acronis True Image) i umieścić go na innym dysku.

Po wykonaniu obrazu zrobić Check Disk dla partycji D i zaznaczyć opcję "automatycznie naprawiaj błędy systemu plików"
Podpiąć dysk z powrotem do maszyny i sprawdzić czy wszystko OK.

Jeśli nie, to możliwe, że dysk po prostu mógł paść fizycznie.
Wtedy masz poważny problem jeśli wcześniej nie zrobiłeś kopii zapasowej CAŁEGO dysku.

Jednak żeby się o tym przekonać, możesz podpiąć dysk do innego kompa, po czym odpalić go z (ogólnodostępnej w necie i darmowej) płyty "Hiren's Boot"
Płytę ściągasz, wypalasz, odpalasz z niej kompa, z menu wybierasz "MiniXP"
Uruchomi się WinXP, a tam z dostępnych narzędzi dyskowych wybierasz jakiś program do sprawdzania powierzchni dysków.
Program po "przemieleniu" dysku pokaże, czy masz bad sectory na tym dysku, jeśli tak i jest ich dużo, to znaczy, że dysk albo kończy swój żywot albo jest tuż przed "śmiercią"
Możesz przy okazji sprawdzić S.M.A.R.T dysku i jeśli status SMART-a będzie "BAD", to dysk do wymiany.