Dlaczego sądzisz że osie są odwrócone?
Ktoś budując maszynę przyjął takie ustawienie osi. Zwyczajowo oś Y jest najdłuższa osią oś X jest poprzeczna do Y w poziomie. Mylące też jest umiejscowienie pulpitu i odniesienie miejsca gdzie jest pulpit do osi maszyny.

A jeśli upierasz sie tak przy zamianie to najwygodniej przepisać ustawienia osi piny step dir w ustawieniach silników. Dalej wypada przepisać parametry osi przyśpieszenie/ prędkość podział kok/milimetr
oraz krańcówki i ograniczenia programowe jeśli są podane zakresy pola roboczego i bazowanie.