Luz osi Y?
Wytnij ten sam detal, ale nie jadąc kwadrat dookoła, tylko zacznij np X0 Y0, pojedź w osi X, później Y.
Wróć (bez cięcia) na pozycję startową i pojedź pozostałe dwie krawędzie.
Chodzi o to, żeby w trakcie cięcia osie zawsze pracowały w tę samą stronę.

Możesz też pobawić się czujnikiem zegarowym i sprawdzić reakcję osi na zadawanie pozycji. Przydałby się czujnik mikronowy do tego.