W przypadku twojej konstrukcji nie widzę problemu ze stołem. Ponieważ jak piszesz twoja frezarka ma głownie wiercić a tylko czasem trochę frezować, to najlepiej zrobić konstrukcję z ruchomą bramą a nieruchomym stołem. Wtedy na stół przykręcasz płytę wiórową, która może być nawiercana. Z twojego opisu wynika, że będziesz robił dużo powtarzalnych elementów, więc przy wierceniu wystarczy jak do stołu przykręcisz wkrętami do drewna listwy bazowe między które będziesz wkładał wiercony element. A przy frezowaniu też możesz mocować elementy za pomocą wkrętów. Jak płyta na stole będzie już bardzo "zmasakrowana" to ją po prostu wymienisz na nową.