Nie znam Mach3, ale na pierwszym ekranie jest napisane, że można używać tylko pinów 10-13 i 15. A definiujesz 4 i 5. Może to dotyczy tylko LPT, skoro krańcówki jednak działają.
Spróbuj jak radzi ktoś wyżej, wyłączyć krańcówki i zostawić tylko bazowanie. Sprawdź czy wtedy cofa.