Nie ma takiej zasady.
Program piszesz tak, jak ci wygodnie, przyjmując jakiś punkt, jako zerowy. Ja na przykład przyzwyczaiłem się na tokarkach do punktu zerowego na czole, w osi, ale można też od strony szczęk (wszystkie wymiary w "Z" dodatnie. Podobnie na frezarkach, jeśli jesteś programistą, to dajesz program ze szkicem, gdzie sobie punkt zerowy przyjąłęś, czy na "rogu", czy w osi, czy jeszcze w innym miejscu.