Pod stepem objaw był taki sam - zawsze przy nawrocie zgubiony impuls.
Problem rozwiązałem studiując manuala nowszej wersji sterownika i szukając parametrów sygnałów ( instrukcja którą posiadam nie ma kilku stron w tym tej

Zmieniłem tryb pracy sterownika jednym z parametrów ( u mnie Pr29) z wartości 1 na 3, co zamieszczam na zdjęciu.

I wszystko już jest ok,żadnego zgubionego impulsu nawet po kilku godzinach testów a kombinowałem z różnymi trybami połączeń, szukałem układów wydłużających czasy sygnałów czy różnicujacych, a rozwiązanie było stosunkowo proste- gdyby mieć dobrą dokumentacje.
Pozdrawiam wszystkich służących dobrą radą.