Znalazłem rozwiązanie problemu bez tak drastycznych metod, więc zamykam temat.
W konfiguracji jednego z nieużywanych agregatów było wprowadzona nazwa nieistniejącego już narzędzia. XNC przez to nie nadpisywało wszystkich pików konfiguracyjnych aktualnie wprowadzonych narzędzi i dlatego wywalało błąd.

Czy ktoś z forumowiczów pracujący na centrach BIESSE ROVER mógł by pomóc?
Na obrabiarce Biesse Rover 30 sterowanie XNC1.2, od jakiegoś czasu nie mogę wprowadzić wierceń z optymalizacją. Po wpisaniu parametrów wiercenia i wciśnięciu ikony optymalizuj wywala błąd:

OPT (*) 10468!
OPT 1000208 >(MAIN:F 8 : The XNC machine data converter service returned error [1])