Mam coś podobnego w emc2 - podczas testowania osi w stepconfie chodzą czyściutko do 1500mm/min, po odpalaniu głownego inteface przy tej prędkości (nieważne czy strzałkami czy przez G0) gubi kroki. Problem prawdopodobnie leży w zbyt słabym (w stosunku do używanego interface) komputerze - stepconf ma praktycznie statyczne okno, axis cały czas rysyje ścieżkę narzędzia w 3D. Większe obciążenie procesora, większy jitter (u mnie da się rozpoznać "na słuch" czy oś jest testowana w stepconfie czy pod axis) no i mniejsza prędkość max...

ps. tak tux - komputer też jest g...