Wszystko gra ale jak zwykle chodzi o kasę.
Jeśli zbudujesz sterownik do pięciofazowego to będzie zawierał 3 układy L298. Przy użyciu go do silnika dwufazowego jeden z tych układów nie będzie pracował.
Nic nie stoi na przeszkodzie by zaprojektować dwa sterowniki dedykowane.

Może Kolega zdradzi cel przedsięwzięcia?

Witam.
Ambitny projekt.
Sterownik zwykle jest dedykowany do konkretnego silnika i przeważnie pracuje z nim do śmierci technologicznej lub awarii. Oczywiście można zbudować sterownik do wszystkiego ale jak to mówią: "Jak coś jest do wszystkiego, to jest do niczego" co jest prawdą.
Schemat, który proponujesz narysowany jest mniej niż w połowie. Staraj się trzymać kierunek przypływu sygnału tzn. wejścia np. po lewej stronie a wyjścia po prawej. Narysuj jak widzisz podłączenie silnika do sterownika, może wówczas więcej Kolegów wyrazi swoje zdanie.
Trzeci, typowy sygnał sterujący to ENABLE - aktywacja, włączenie prądu silnika.
Mikrokrok jest możliwy w silniku pięciofazowym, jednak trzeba wiedzieć jak połączone są uzwojenia.