Pewnie będzie w Dir Pulse. Na początek proponuję 5.

W zakładce Config->Motor Tuning, na samym dole formatki jest pole edycji Direction PreChange. Proszę wpisać 60 i zatwierdzić.

Były już takie przypadki na forum.
Podczas zmiany kierunku ruchu oś Z musi się zatrzymać. Kiedy sygnał DIR zmieni wartość sterowanie powinno odczekać kilka ms zanim wyśle impulsy STEP w nowym kierunku. Jeśli tego nie zrobi, sterownik może "przeoczyć" jeden impuls. W trakcie pracy błąd pozycji będzie się powiększał. Wielkość w/w opóźnienia jest ustawialna i trzeba ją dobrać eksperymentalnie tak, by nie była za duża, co z kolei wpłynie na wydłużenie całkowitego czasu wykonania kodu.
Jakim programem Kolega steruje?