ATMega może trochę nie wyrabiać. Ma 20mA na wyjście, ale wtedy spadek na wyjściu jest już dość duży.

A4899 jest przystosowany do 2 faz.
A tutaj trzeba sterownik 3 fazowy.
W dodatku sekwencje nie mają nic do rzeczy bo A4899 nie pozwala ustawić własnych sekwencji. No chyba że pisząc o sekwencjach miałeś na myśli sterowanie bez użycia A4899.

Zarzut był do korzystania z kodów z internetu o których nic nie wiadomo.

Ilość faz oznacza ilość niezależnie sterowanych biegunów magnetycznych. Co prawie zawsze było równe ilości cewek. Ale że Chińczycy szukali oszczędności to wywalili jedną cewkę skoro bez niej silnik dalej i tak jako tako działał.

Silnikiem sterowałem i działał dość dobrze. Ale jednak było widać że to nie to co mogło by być.
Najważniejsze części w moim kodzie są takie: Gdzie T oznacza tranzystory. 1 2 3 i 4 numery wyprowadzeń silnika (i widać że wyprowadzenia 2 i 3 są połączone razem).
A L i H to dolne i górne tranzystory.
Czyli T1H_On oznacza że to włącza tranzystor górny do sterowania wyprowadzenia 1. Czyli że podaje VCC na wyprowadzenie 1.

Wcześniej sobie zadeklarowałem na których pinach jest jaki tranzystor: I jak widać T1H_On to 0.
Bo to był tranzystor PNP. Czyli żeby podać H na wyjście, to musiałem podawać L (masę) do sterowania tranzystora.

A gdzieś w Timerze po prostu wpisywałem na port odpowiednie stany: I jechałem krokami do przodu: albo do tyłu: Przerwanie miałem o częstotliwości 250Hz. Zmienna Silnik była 16 bitowa.

Sterowany krokami dostosowanymi do niego, będzie robił zawsze takie same kroki.
Problem że ludzie próbują sterować takimi silnikami za pomocą tablic dostosowanych do zwykłych silników (z przesunięciem faz 90°) i wtedy wychodzą różnice w długości kroków co trzeba korygować.
A wystarczyło by sterować zgodnie z danymi z datasheeta i nie było by problemu.

To co podałeś to jest właśnie to o czym piałem.
Mało tego, pisałem o dokładnie takim samym silniku.
Ja kupowałem prosto w Chin nowe. Nazywały się VID29.
I jest tak jak pisałem: fazy są co 60° a nie co 90°.
To że silnik ma wyprowadzone tylko 2 fazy (z 3) niczego tu nie zmienia.

Zresztą widać to na rysunku modelu silnika, tylko niedokładnie się przyjrzałeś.
Cewki są dwie po bokach, ale to nic nie zmienia. Bo liczy się droga magnetyczna. A po kształcie blaszek widać że pole z tych cewek trafia na wirnik z 2 stron od góry. Pod kątem 120°. A na dole (na rysunku nie widać, ale ja rozbierałem taki silniczek) jest jeszcze zwora magnetyczna. I ona pełni rolę 3 fazy. Powstającej samoistnie, bez cewki.
Dlatego silnik w rzeczywistości jest 3 fazowy, mimo że ma wyprowadzone w postaci cewek tylko 2 fazy.
Nawet na wykresie który przedstawiłeś widać że przebiegi są przesunięte o 60°.

1. To znaczy że ma 200 pełnych kroków. Czyli 50 sekwencji załączeń cewek przy sterowaniu pełnokrokowym (bo sekwencja to 4 załączenia).
2. To po prostu jest jakiś błąd. Powinno być 4 albo 8.

A jesteś pewien że jest to klasyczny silnik krokowy 2-fazowy?
Bo do sterowania wskaźników wskazówkowych zwykle się stosuje silniki 3-fazowe z wyprowadzonymi tylko 2 fazami.
Tzn. z punktu widzenia sterownia jest to jakby silnik 2-fazowy ale z fazami przesuniętymi o 60° a nie o 90°.
Najlepiej to daj zdjęcie tego silnika.