Raczej będziesz musiał skorzystać z co najmniej dwóch programów. Jeden do projektowania PCB a drugi do grawerki.
Do PCB z doświadczenia mogę śmiało polecić KiCad. Z darmowych chyba najlepszy.
Z niego wygenerujesz gerbery a je możesz wrzucić np. do FlatCAM-a.