Witam.
Jeżeli korzystasz tylko z dwóch baz można jeszcze to zapisać z użyciem parametrów R.

N4 G0 G=R101 X100 Y20 Z50 (WYWOLANIE PIERWSZEJ BAZY )
N5 G1 X50 F1000
N6 ...
N50 G=R102 ( WYWOŁANIE DRUGIEJ BAZY )
N51..
N52..
N53 M17

Wartość R101, R102 wpisujesz w programie głównym przed wywołaniem podprogramu
Pod parametrami R101 i R102 będą oczywiście numery baz
dla pierwszej palety G54 i G55
dla drugiej G56 i G57

%MPF0001 (PROGRAM GLOWNY)
N2 G0 G53 Z0
N3 G0 G53 X0 Y0
N4 M31 (STOL NR 1)
N5 R101=54 R102=55 L0002
N8 G0 G53 Z0
N9 G0 G53 X0 Y0
N10 D0
N11 M32 (STOL NR 2)
N13 R101=56 R102=57 L0002 (PODPROGRAM 0002)
N14 M30 (KONIEC PROGRAMU)

w tym przypadku wykorzystasz wszystkie cztery bazy, ale wszystko zrobisz w jednym podprogramie.

Witam.
W Twoim przykładzie proponuję wyrzucić G54 z podprogramu i wpisanie baz w programie głównym przed L0002 np.
N4 M31
N5 G54 L0002 P...
..
..
N11 M32
N13 G55 L0002 P...