To chopper sterownika decyduje ile prądu pójdzie na silnik biorąc pod uwagę na pewno parę różnych czynników.

Moje przypuszczenia dotyczące niskiego napięcia zasilania z postu na samej górze strony się sprawdziły, więc klikaj pomógł

Tak bez obrazka, to nie umiem.
Bez kompletnego schematu nikt tu nic nie wyduma.

Możesz trochę zwiększyć napięcie zasilania układu?
W momencie szczytowym zaczyna się kasza bez względu na częstotliwość.

Ew. filtrowanie zasilania układu. Możesz dołożyć jakiś kondensator oczko mniejszy?
To jest układ Twojej własnej produkcji, czy "firmowy"?
Może nie ma kondensatora prosto przed tranzystorem kluczującym? Wtedy ten 22F działa tylko jako magazyn prądu, a nie spełnia roli filtra.

A możesz pokazać, jak układ się zachowuje przy niższej częstotliwości kroku?
Z czego masz takie ładne wykresy?

Ja też nie zrozumiałem. Myślałem, że ktoś mądrzejszy wskaże tranzystor choć jeden na tym schemacie...

A jak zmniejszych napięcie, które wysterowuje sterownik silnika krokowego (a tak dokładnie to chopper), to też jest tagi grzebień? Może po prostu masz taki chiński chopper...