W tym MPC6565 jest tylko jedno wyjście do dmuchawki i w LaserCut są opcje kiedy ma dmuchać (stale, przy pracy, wcale).

Podejrzewam, że output3 to może być wyjście związane z podawaniem materiału - dodatkowy osprzęt do lasera. Rzadko używane więc nic na schemacie nie dorysowali.

"Output3" czyli wyjście4.

Fizycznie czujnik przepływu wody jest w chłodnicy wody. Oprócz zasilania chłodnice wodne mają dodatkowy przewód sygnałowy do lasera. Na schemacie, który pokazałeś jest to środkowy pin z grupy INPUT spośród tych pięciu: 24V, GND, Water Protect, czujnik magnetyczny pokrywy, pedał.
Jak widzisz pin jest zwarty do GND czyli czujnik jest w tym schemacie pominięty.
Aby go użyć daj dwa przewody do GND i Water protect.
Zwarte do masy - jest przepływ.
rozwarcie - odcina zasilanie tuby.