Najpierw konfigurujesz w konfiguracja/krańcówki/bazowanie, a nastepnie klikając bazowanie w łównym onie programu robi się to co napisałeś, czyli następuje po kolei dojazd do poszczególnych krańcówek i zerowani poszczególnych osi(lub przypisanie wartości z ustawień)

W machu masz przycisk do bazy. Klikając go program( zgodnie z ustawieniami zawartymi w konfiguracja/bazowanie-krańcówki) bazuje pokolei poszczególne osie. W ten sposób program wie gdzie jest jego baza(punkt odniesienia dla swojej dalszej pracy). Nie wiem czy o to Ci chodziło .