Z tego co czytałem wynika, że nigdy nie należy podawać zasilania
na sterownik, gdy silniki są niepodłączone, dalej,
fizyczne odłączenie silnika od zasilanego sterownika,
również może spowodować "siwy dym".

Przed odłączeniem silników od sterownika,
należy odczekać chwilę na rozładowanie się kondensatorów
na linii zasilającej (lub przedtem dokonać pomiaru napięcia).

źródło powyższej inf. np. tutaj:

http://www.pololu.com/catalog/product/1183

nie wiem, czy dotyczy to wszystkich sterowników,
eksperymenty (jak widać) niektórzy już przeprowadzili.

Kolega Leoo w swoim albumie, umieścił już jakiś czas temu,
schemat prostego zabezpieczenia przed "Back EMF".