Nie mogę dojść przyczyny dlaczego po wygenerowaniu kodu na frezarkę podnosi mi oś Z zamiast ją opuszczać.

G-kod wygląda też niczego sobie (obrazek). Schodzi w kilku przejazdach na 2mm. Powinno działać. Zero materiału na maszynie ustawiasz dobrze ?
Możesz za to wywalić albo zakomentować (średnik na początku) trzecią linie: N20G91G28X0Y0Z0

G-kod (widok z boku)