Wygląda mi to na brak aktualizacji wiązań, po zmianie wymiarów jednego z elementów złożenia.
NX9 to pikuś, bo to wersja "do zapoznania się z nowościami", gorzej z 7.5, ale tutaj właśnie kliknięcie któryś więz aktualizuje wszystkie.

Dlaczego wiązania wysypują się po zmianie geometrii elementu, do którego, związano inne elementy, jak pokazano to na załączonym zdjęciu?
http://zapodaj.net/cd898260abc12.jpg.html

Dotyczy to NX7,5 update 4 no i NX9.
W NX7.5 bez update zmiana wymiaru na szkicu powodowała aktualizację wiązań geometrycznych. Wszystko działało jak trzeba.