To potem musisz zrobić jeszcze takie wycięcie jak poniżej. Są pewnie i inne sposoby na to np. coś się pobawić z operacjami boole'a ale ta jest chyba najprostsza.

To nie widzę problemu. Zwykłe wycięcie tylko wybierasz rodzaj płaszczyzny styczna. Klikasz na walec, ustawiasz pod jakim katem ma być płaszczyzna. Rysujesz okrąg i jedziesz.

W module tradycyjnym nie byłoby z tym problemu.