najprościej chyba po prostu ruszyć każdą osią na pusto o milimetr w jedną a potem w drugą stronę przed rozpoczęciem frezowania

A ustawianie pozycji 'zero', które pewnie jak każdy wykonuję zawsze, nie jest takim pustym przejazdem?

Może podział kroku na sterowniku jest taki, że Ci obcina te 0,1mm, albo masz frez o niedokładności 0.1mm. Ja bym obstawiał to drugie. Przy frezowaniu czegokolwiek trzeba brać dokładność narzędzi + maszyny.
I jakim frezem i przy jakich parametrach i z jakiego programu kolega frezował pcb?? Prosiłbym o szczegóły:)

Podział kroku jest raczej dobry: 400 kroków, silnik 1.8 deg/step, sterownik 1/2 kroku.
Mam śruby trapezowe (16x4), steruje Machem, frez (węglik) początkowo 3mm, a potem 1mm, żeby wybrać zaokrąglenia w rogach otworów prostokątnych.

A czy sterowniki i silniki coś już robiły po włączeniu a przed wycinaniem pierwszego otworu.
Bo czasem jest tak, że silnik jest w jakiejś "dziwnej" fazie na początku i po włączeniu zasilania dopiero "wskakują" na właściwą pozycję.
Po drugie - niektóre sterowniki włączają zasilanie silnika dopiero po pierwszym sygnale STEP.

Jakie testy mógłbym przeprowadzić, żeby potwierdzić albo wykluczyć dana opcję?

Zgodnie z zapowiedzią, umieściłem w mojej galerii kilka fotek mojej maszyny.
Tutaj zajawka:

Wałki niepodparte (20mm) u mnie zdają egzamin, przy założeniu, że frezuje jak na razie plexi i graweruje PCB.
Co do dokładności: nie do końca wiem jak intepretować wyniki, które osiągam.
Zaprojektowałem powiedzmy panel z wieloma otworami pod przyciski klawiatury.
Otwory są prostokątne, wg. projektu 15x10mm. Maszynka wycina je tak: 14,9x9,9mm, przy marginesie otrzymanych wymiarów 0,05mm.
I teraz nie wiem skąd sie bierze ten początkowy błąd 0,1mm, skoro potem maszynka trzyma wymiary każdego z wyciętych otworów.

Idzie weekend. Zrobię kilka fotek.
Będzie to debiut mojej maszynki na forum, więc trochę ja muszę ogarnąć
Napisze też coś o dokładności, bo to nie jest oczywista sprawa

Moja maszynka z MDF 22mm jest bardzo podobnej konstrukcji, z tym, że u mnie są niepodparte wałki 20mm w każdej osi.
Z tego co widze u Ciebie:
- oczywiście oś Z na czterech łożyskach, nie dwóch,
- oś Z moim zdaniem nie jest zbyt wysunięta. U mnie jest podobnie i działa,
- dałbym jeszcze deche na góre bramy. Nie zaszkodzi sztywności, a miejsce na to masz,
- śruby polecam min.16mm plus nakrętki IGUS. Do pracy w miękkich materiałach wystarczy, a odpada problem kasowania luzu,
- silniki: ja mam 1.26Nm i są za słabe. Tzn. kręcą, ale wolno. Zmieniłbym na 1.9Nm, bo mój sterownik to uciągnie,
- z elektroniką nie eksperymentowałem, kupiłem gotowy zestaw na Alledrogo, dopasowany do wybranych silników (też Alledrogo).

Jak będzie wyglądać samo mocowanie wrzeciona?
Ja robiłem próby z wykorzystaniem MDF, ale dałem sobie spokój, bo MDF nie był w stanie znieść
naprężeń przy zaciskaniu i trzymaniu wrzeciona.
Wykorzystałem to:
http://www.cnc-plus.pl/uchwyt-mocowanie ... iona-43mm/
sprawdza się idealnie.

Jak będziesz montował to wszystko razem? Jakie śruby?

Jak chcesz, mogę podesłać kilka zdjęć maszyny, komponentów, czy rezultatów pracy.

Pozdrawiam i życzę powodzenia,
mefiu