2. Koniecznie chcesz robić maszynę na takim łożyskowaniu jak wybrałeś? Kto wykona te łożyska? Moim zdaniem nawet jak nie będzie luzów stołu w pionie, to będą w poziomie.
3. Koniecznie bramę chcesz robić z 40mm? Do gipsu i PCB spokojnie wystarczy 22mm.
4. Wałki 12mm za cieńkie.
5. Silniki OK.
6. Ogólnie mam wrażenie, że w miejscach łożyskowania, a szczególnie na połączeniu osi Y i Z taka konstrukcja będzie się mówiąc najogólniej gibać

Jeżeli dodatkowy koszt nie będzie dla Ciebie problemem, sugeruję jednak klasyczne rozwiązania z łożyskami (zamknietymi/otwartymi) w kupnych obudowach. Przynajmniej wiadomo, czego można się spodziewać.