Mogę dać silnik na podłużnych otworach (mimośrodowych to się chyba nazywa?)

Nie. Mimośród to koło z otworem wywierconym nie w środku a minimalnie obok ( niecentrycznie ). Masz rower z siodełkiem/kołami mocowanymi na zacisk ? To jest właśnie mimośród z dodaną dźwignią. Też miałem problem co to właściwie jest. Bez rysunku na Wikipedii jak bez ręki .

(...)nie wiem co się może stać gdyby wózek w coś uderzył na końcu toru.

Przede wszystkim warto zamocować i podłączyć krańcówki, czyli przyciski na końcach dozwolonego zakresu ruchu każdej osi. Gdy sterownik/program sterujący dostaje sygnał z takiego przycisku wyłącza maszynę/oś.