Ja bym sprawdził czy to co opisujesz zgadza się ze stanem faktycznym bo też ostatnio kupiłem płytę 4 osiową ale wyjścia sterujące ostatnio osią były na wtyku DB15 czyli nie da się nią sterować z LPT.
O ile masz logiczne 1 to sygnałami enable nie musisz się przejmować - sterowniki w tedy domyślnie są włączone dla wszystkich osi.

A masz opis pinów wejściowych/wyjściowych w swoim modelu PCB ?