Nie wiem, jak masz opisane narzędzie. zobacz z instrukcji rysunek 3.26 i sprawdź, czy masz tak samo. Przecież, jak jest dobrze, to kompensacja będzie się objawiać na przejściach pod kątem. Na przejściach po osiach masz odsunięcie o pełny promień, przemyśl, moim zdaniem błąd jest w opisie narzędzi.

Przeanalizuj rozdział 3.8.4.2 (Zejście z toru skompensowanego): http://www.pronum.pl/pomoc/insprot.pdf

Może ty źle schodzisz z konturu, dlatego kończy ci wcześniej, o wartość promienia, może zejście z kompensacji masz poprzez odejście w górę i dlatego nóż dosunie się o wartość promienia, ale już na górze, nad materiałem. Trzeba by przeanalizować "blok po bloku", jakie ruchy robi nóż.