Zanim zaczniesz mówić komuś czy ma się udzielać w danym temacie przejrzyj jakikolwiek katalog diod schottky'ego. Są elementy o kosmicznych parametrach, ale to trzeba się w życiu spotkać z energoelektroniką a nie uważać że wie się wszystko jak się trochę pogrzebało w elektronice...

Widziałem pomiary gdzie przekaźnik na 5V generował pik o natężeniu 500V. Generalnie silnik robi podobnie i nie jest to problem. Ale trzeba dać diody które zatrzymają ten pik na poziomie kilku-kilkudziesięciu woltów.

Niekoniecznie zwarcie, potrafi się zrobić też rozwarcie. Drugi przypadek lepszy bo wystarczy wymienić element półprzewodnikowy.
Polecam dać nawet zwykłe diody schottky'ego na odpowiedni prąd. Tak jest robione w wielu układach i działa. Schematy masz tutaj, tylko użyj diody takiej jak pisałem:


Możliwe że problem jest gdzie indziej, bo to dość podejrzane że pali się fabryczny sterownik. Czy może Ty sam go dodałeś?