Pewnie dużo taniej byłoby użyć linuxcnc, a wtedy masz G61 i po temacie.
Jakim programem generujesz gkod? Słabe camy generują krzywe jako ciąg odcinków zamiast zamienić je na łuki. Problem pozostanie ale będzie występował dużo rzadziej.

Swoją drogą coś z tymi płytkami Arduino jest, warto się przyjrzeć, bo to już któryś temat, że się resetuje. Ja też z tym walczyłem, mi się resetowalo, czasami nawet potrafiło skasować ustawienia z eeprom po takim resecie a bywało też, że coś się działo z softem, że po resecie już wogole nie chciał działać i pomagało jedynie wgranie softu od nowa. U mnie problem po długich perturbacjach rozwiązałem, wcześniej wymieniając już wszystko. Pomogło dopiero założenie ferrytow na przewód uziemiający w maszynie (krótki przewód uziemiający od zasilacza i od ramy do bolca uziemiające go w gnieździe).