Mógłbyś to policzyć w jakimś innym programie (np. studencki Inventor czy Fusion 360 albo coś open-source), korzystając z wyeksportowanego modelu w formacie STEP. Tylko analiza MES da Ci tu dokładne wyniki.

Uproszczone obliczenia będą właśnie takie jakby otworów nie było. Zresztą te otwory są mimo wszystko dosyć małe w stosunku do całej belki i pominięcie ich wpływu na wytrzymałość i sztywność na zginanie nie będzie takim dużym błędem. Głównie będą powodowały koncentracje naprężeń, ale dla takiego przypadku raczej nie ma gotowych wzorów (ew. zobacz w "Peterson's Stress Concentration Factors"). Współczynnik bezpieczeństwa zawsze możesz trochę zwiększyć żeby upewnić się, że konstrukcja będzie wystarczająco wytrzymała.

Co do wyboczenia, musisz przyjąć jakiś schemat podparcia z tych klasycznych, opisanych w dokumencie. W zależności od tego należy przemnożyć faktyczną długość pręta przez odpowiedni współczynnik. Zastanów się jakie ograniczenia ruchu końców prowadnic występują w tym przypadku. Tutaj jest jeszcze dodatkowe podparcie w postaci tulejek, w których są prowadnice, ale tego raczej nie uwzględnisz. Kolejny powód żeby użyć MES.

Masz już model w SolidWorks, więc najlepiej by było zrobić analizę MES w module Simulation. Ręcznie i tak tego dokładnie nie policzysz, nie jesteś w stanie uwzględnić wpływu tych otworów. Możesz to policzyć jedynie w uproszczony sposób, korzystając ze standardowego podejścia przy zginaniu i ew. wzoru Eulera jeśli chcesz też policzyć w uproszczeniu prowadnice na wyboczenie.

Z literatury proponuję "Prasy hydrauliczne" Gosztowtta oraz "Napędy hydrauliczne pras i młotów" Boczarowa.