Skoro odchyłka jest taka sama na wszystkich gniazdach to na pewno nie głowica. Tam nie należy dotykać bez ważnego powodu, potem to ustrojstwo ustawić to już trzeba wiedzieć jak, a i czasem serwis ma z tym kłopoty. Wracając do Twojego przypadku to sądzę iż te 1,4mm to suma odchyłek wrzeciona, i suportu (zarówno w osi X jak i wózkach teoretycznej osi Y). Aby maszyna działała jak należy trzeba by ją pomierzyć na wrzecionie i głowicy. Tylko to da pełny obraz sytuacji.
Dobrze kombinujesz, pierwszy raz przez serwis i obserwować co i jak on robi.

1.4mm to dużo...bardzo dużo. Tyle nie wyciągniesz na śrubach od wózków. Wózki są przykręcone śrubami chyba 3/8' ale nie pamiętam dokładnie, a otwory pod te śruby na pewno nie są z luzem 1,4mm. Jeśli nie masz osi Y to dziwi mnie aż takie przesunięcie Spindle center. Czy aby na pewno dobrze zmierzyłeś tą odchyłkę? Sprawdź to na kilku gniazdach, najlepiej na krzyż np. 1-7 i 4-10 wtedy masz najlepszą wiedzę w która stronę poszła głowica. Jeśli pomiary na gniazdach będą zbliżone to odkręcanie śrub z czoła głowicy i walenie młotkiem tylko pogorszy sprawę.Skasujesz sprzęgło albo utracisz dokładność zapinania tarczy i będziesz miał loterię z wymiarami nawet na nożu. Znajdź kogoś kto robił już takie rzeczy albo dzwoń po serwis. Wiem że nie takiej odpowiedzi oczekujesz ale uwierz, ustawienie samej głowicy to 1 dzień roboty, ustawienie suportu na wózkach to 2-3dni. A jak ktoś rozjedzie całą geometrię to i tydzień czasami nie starczał.

PS.
Te 1,4mm na wózkach nie pójdzie jeszcze z jednego powodu... mocowanie nakrętki na śrubie pociągowej. Tam nie udało mi się wyciągnąć nigdy więcej jak 2-3 dychy! Bez popuszczenia mocowania nakrętki skrzywisz śrubę i parę tysi popłyniesz.

PS2.
Jeśli prawdę powiadasz (prawdę zmierzyłeś) i masz te 1,4mm w osi Y to poszło wrzeciono, ale to jest najmniej prawdopodobne. Nigdy jeszcze nie widziałem walniętego wrzeciona tak że nie ciągnęło by stożka.