Na 99% to nie program tylko coś z maszyną.
Nie było w ostatnim czasie jakiś dziwnych alarmów, nawet mało związanych z osiami?
Może krańcówka się kończy i co jakiś czas daje błędny sygnał przez co sterownik się gubi.
Może jest jakiś błąd w sofcie i należy wykonać reset systemu.
możliwości jest kilka ale to raczej nie program. Puść jakiś inny sprawdzony program, nawet na sucho bez detalu i narzędzi.