Trochę dziwią mnie te problemy, bo generalnie jeżeli ekranowanie jest poprawnie wykonane, zasilania mają filtry to nie powinno się nic dziwnego dziać, w końcu zasilacz komputera robi ogromny chaos w sieci a mimo to wszystko działa.

Swego czasu miałem podobne problemy przy wzmacniaczu dźwięku i po około tygodniu gapienia się w pudło zrozumiałem, że jednak mam źle ekrany podpięte. Mimo wszystko zaczynał bym od tego
Można też spróbować zastosować filtr ferrytowy na zasilaniu elektroniki, metalowa obudowa skrzynki uchroni przed zakłóceniami elektromagnetycznymi.

"Masę" agregatu masz dobrze zamocowaną do materiału (rusztu)?