Też nie rozumiem jak można się pomylić...
Program ma wszystko po polsku opisane. Tyle że bez błędów ortograficznych
Do tego w camie WIDAĆ uzyskaną ścieżkę narzędzia. I nawet można zrobić pomiary na ekranie przy pomocy myszy.

Po prostu nie da się spieprzyć roboty. Chyba że się wjedzie niechcący w uchwyt albo poza materiał. Albo zapomni wybrać narzędzia o wymiarach zgodnych z rzeczywistymi. Czyli z gapiostwa.

Zmiana narzędzia w piko oraz sam mechanizm kontroli położenia końcówki narzędzia jest średnio wygodne i średnio użyteczne.
Piko, ryzykując kolizję, jedzie tam gdzie jest zadeklarowany pomiar długości, tak jakby to miało mieć coś wspólnego z miejscem gdzie można wymienić narzędzie. Narzędzie wymienia się zwykle tam gdzie jest operator, czyli z przodu, czyli w obszarze stricte roboczym. A czujnik narzędzia, o ile w ogóle, umieszcza się zwykle w martwym z punktu widzenia obróbki punkcie maszyny. Żeby po prostu nie przeszkadzał.
Ja po prostu robię to ręcznie, bo nie mam zaufania do automatu. Przynajmniej nie na tym etapie rozwoju programu. Poza tym, zależnie od zamocowania wrzeciona, narzędzie po prostu potrafi nie sięgać czujnika. Zaczynając pracę wielonarzędziową trzeba sobie najpierw przygotować środowisko do pewnego pomiaru narzędzia i spisać na kartce liczby związane z długością w stosunku do materiału. Żeby móc później wklepać ręcznie korektę po zmianie frezu.
Narzędzie nie zjedzie do czujnika Z-ką, jeśli nie masz zaznaczonej obecności czujnika w opcjach. Tylko dojedzie do miejsca XY jego hipotetycznego położenia.

Maszyna 1/2 > Osie > Bazowanie osi. Dla każdej osi trzeba ustawić parametry osobno.

Nie rzeźbię w drewnie więc nie podpowiem. Poza tym drewno drewnu nie równe.

Masz opcję krok zagłębiania. Podajesz w milimetrach a po prawej program poda Ci ile będzie zagłębień i jaka głębokość ostatniego (planującego). Jeśli będzie bez rampy, wtedy wyjdzie skokowo. Jeśli podasz rampę wtedy zagłębianie będzie wg rampy.
To tyle w kwestii prostego frezowania 2,5D.
Frezowanie modelu 3D to oddzielna sprawa, jest dużo możliwości (strategii) wyboru trybu wycinania. Zwykle najpierw wycina się model zgrubnie z naddatkiem grubszym frezem, i dopiero taki półfabrykat obrabia się czasochłonnie dobranym optymalnym trybem, częściej więcej niż jednym, żeby nie było śladów obróbki a czas pracy sensowny. Ale przy płaskorzeźbie wystarczy zwykłe kreskowanie
Pewnie ograniczyłeś głębokość obróbki do 0,5mm i dlatego dostałeś zarys tego co miało być.