Używam wszystkich możliwych w piko przycisków fizycznych i od wersji 205 do ostatniej nie zauważyłem żadnych problemów z tym związanych.
Nie pamiętam jak to było wcześniej zrobione, ale przyjrzyj się ustawieniom parametrów osi, upewnij się że masz wyłączone krańcówki mechaniczne. I czy aby na pewno nic nie pogrzebałeś w kabelkach, choćby i niechcący, w międzyczasie? Może nawet coś się zwarło?
Przy przechodzeniu z wersji na wersję teoretycznie mogą się pojawić problemy z plikami konfiguracyjnymi. Nigdy nie wiadomo co autor zmienił i czy wszystko dokładnie przetestował. Lepiej zrobić sobie najpierw zrzuty ekranowe nastaw, wykasować starą instalację dysku a potem wklepać wszystkie parametry od nowa na czystej instalacji.
Ja zawsze tak robię z każdym oprogramowaniem.