(pobór prądu przez regulator jest znikomy).
Zasilacz 12V ma małą regulację napięcia, możesz dać na minimum,
pewnie wyjdzie jakieś 9V i stabilizator 5V będzie się mniej nagrzewał.
Lub:
Regulator zasilasz 5V a np. nóżkę nr 3 układu IC2A dajesz na wejście STEP A4988, który
umieszczasz w miejsce wylutowanych, zbędnych BUZ10

Czyli ten regulator wykorzystujesz jako generator fali prostokątnej więc będzie wykorzystany

Tak naprawdę wystarczy zostawić
CON1, C2, C3, R7, R2, PR1, C1 oraz HCF4093 (IC2A i IC2B) - reszta zbędna.
plus A4988 i stabilizator 5V, który posiadasz.
Stabilizator 5V umieszczasz w miejsce któregoś BUZ10 i od spodu kombinujesz
by wszystko grało i ładnie wyglądało.