Wartość C – oś w jakiej jednostce jest podawana?
przeważnie w stopniach.
Przeglądając kontury zauważyłem że w niektórych funkcji G00 brak czy ta funkcja jest konieczna?
G00 tak zwany rapid to posuw "jałowy" (szybkie dojazdy) do materiału, magazynu narzędzi itp, bez możliwości obróbki, dlatego też brak G00 podczas obrabiania materiału.

Mam pytanie czy kody można zamieniać

Nie można, C to nie jest parametr tylko oś obrotowa.