Z Twojego opisu wynika, że masz problem z sygnałem ENABLE dla sterowników. Po włączeniu zasilania komputera stan pinu 17 odpowiada włączeniu sterowników, po wejściu do systemu zmieniany jest na przeciwny – sterowniki milkną. Spróbuj zmienić ustawienie dla sygnału ENABLE w Machu na przeciwne – może pomoże.

Możesz podać listę pinów, z których korzystasz i czy do sterowania wykorzystujesz również sygnał enable sterowników? Można sprawdzić różna konfiguracje portu LPT (SPP, EPP, ECP itd.), zależnie od trybu pracy portu czasami niektóre piny zachowują się trochę inaczej.