Jeśli po partycjonowaniu przez "MiniTool Partition Wizard" nic się nie zmieniło to problem prawdopodobnie leży gdzie indziej - szczególnie jeśli karty są używalne pod Windows.
Niestety - nie mam więcej pomysłów.

tuxcnc - w zasadzie zgadzam się z sugestią żeby użyć live cd ale w miarę możliwości pod kontrolą kogoś kto wie co robi. Albo przed uruchomieniem live CD fizycznie odłączyć dyski w komputerze. Powiedzmy że zdażyło mi się pomylić sdb z sda...

Możliwe że jakiś program do partycjonowania - google doradza "MiniTool Partition Wizard" (nie znam) albo "AOMEI Partition Assistant". Ten ostatni znam ale nie lubię więc zwykle sięgam po linuksa - "nuklearne combo" (dd if=/dev/zero of=/dev/moja _karta_cf. Fdisk /dev/moja_karta_cf) - uwaga, lepiej dokładnie wiedzieć co oznaczają argumenty bo uswa dane że wszystkiego...

formatowałeś pod windows? Jeśli tak - microsoft zmienił coś w formatowaniu kart CF parę lat temu. Nie wiem co dokładnie (obiło mi się o uszy że chodziło o rozróżnienie pomiędzy pamięciami wymiennymi a "dyskami twardymi" albo obecność boot sektora) - w każdym razie kilka małych kart CF po formatowaniu pod win przestało mi działać (nie maszyna CNC ale dość stary komputerek przemysłowy na procesorze motoroli). Pomogło wyzerowanie karty pod linuksem, założenie nowych partycji i ich sformatowanie.