Weź kawałek miekkiego drutu, złap w wrzeciono i wygnij tak żeby przy obracaniu wrzecionem koniec drutu zataczał mozliwie duży okrąg tuż nad stołem (oczywiście przy wyłączonym wrzecionie ). Sprawdź czy odległość pomiędzy końcem drutu a stołem jest stała, nastepnie nie zmieniając obrotu wrzeciona przejedź w inne miejsce stołu. To da ci pojęcie czy oś Z jest nieprostopadła, czy stół krzywy.
Przy odchyłce 0.3mm na ramieniu 25mm (frez 50mm) błąd powinien być łatwy do zobaczenia...
"Profesjonalna" wersja - zamocuj czujnik na odpowiednim ramieniu pomiarowym i zamocuj we wrzecionie.

Narysuj jak dokładnie mierzyłeś tym czujnikiem - z opisu wynika że czujnik był przymocowany do stołu a ramię pomiarowe opierało sie o wałek we wrzecionie. W ten sposób nie da się zmierzyć prostopadłości osi Z do stołu. Twoje pomiary wskazują że oś wrzeciona jest równoległa do osi Z (dobrze) ale "schody" w materiale wskazują że oś Z nie jest prostopadła do stołu.