DA się bez przejściówki. Zobacz rysunek z helpa. Musisz tylko podać właściwe numery na liniach, do których podłączasz sygnału limitu lub home dla poszczególnych osi. Jedna sprawa: przecież sygnały X,Y,Z limits i Home są wejściami (input pins), więc nie szukaj ich w wyjściach (output pins)
Aha, najpierw w zakładce "input signals" podaj które sygnały chcesz wykorzystać (x+ limit x- limit i tak dalej), wciśnij "zatwierdź" i dopiero przejdź do zakładki "input pins" i podaj gdzie sygnały będą podłączone. I obejdzie się bez przejściówek.

Właśnie spojrzałem że w opisie do którego się odwołujesz miałeś tą informację o zakładce input_pins. Po prostu patrzyłeś na wyjścia, a switche muszą być na wejściach.