Czy linux czy windows - nie robi to różnicy, to nie linuxa trzeba przestawiać a zmienić zachowanie programu.

Jeśli autor programu nie przewidział takiej opcji (nie wiem nic o tym aby przewidział) to trzeba zmienić w źródle, skompilować i już... jak nie ma dostępu do kodów źródłowych to d...a.

Nie prościej zapisywać pliki z właściwym rozszerzeniem?

Nie - okno wyboru plików służy do przeglądania zawartości katalogu, jednego, wskazanego katalogu.

Coś próbujesz chyba strasznie przekombinować...